按照精简、统一、效能原则，中国（河南）自由贸易试验区郑州片区管理委员会设3个内设机构，管理一个财政全供事业单位，规格均为正科级。

（一）自贸区政策创新处。负责自贸区相关政策研究、制度创新等工作；负责郑州片区发展战略与功能开发创新研究，提出相关意见和建议等工作。

（二）自贸区行政审批处。负责行政审批等工作。

（三）自贸区对外联络处。负责做好与“一带一路”沿线国家相关合作项目的跟踪服务、招商引资、对外联络等工作。

（四）自贸区综合服务中心。主要负责办事大厅日常运营、管理、服务等工作。